慢性功能性便秘，首选的药物是促进胃肠动力的药物，比如西沙必利，莫沙比利，以及吗丁啉等等，此外也可以服用普卡比利，效果理想，常用的泻药，有容量型的泻药比如硫酸镁，硫酸钠。还可以用刺激性泻剂，比如番泻叶，蓖麻油。还可以用粪便软化剂，液体石蜡或者是乳果糖。也可以外用泻剂甘油栓或者是开塞露等等。应当防止长时间滥用泻剂，而造成泻剂性肠病。此外需要经过饮食进行调理。