卵巢的生发上皮、盆腔腹膜、脐、胸膜同起源于体腔上皮，受到某种刺激如炎症、经血、激素等的影响，可以衍化为子宫内膜样组织，以致形成子宫内膜异位症。但此学说尚无充分的临床和实验依据。

良性转移学说

子宫内膜异位为良性病变，但其有远处转移和种植能力，子宫内膜细胞可通过淋巴或血管播散至腹膜后淋巴结、输尿管、肺及手臂等。

免疫学说

近年来很多研究已证实子宫内膜异性症妇女免疫系统有变化，在动物实验中已证实，细胞及体液免疫均有变化。因此，认为内膜碎片的种植或排斥可能与细胞免疫有关。异位的内膜可因细胞免疫缺陷而发生。