1、影响卵巢功能：研究表明，子宫内膜异位患者的卵泡和黄体细胞上的LH受体数量明显少于正常妇女，出现卵泡发育不足或排卵障碍，引起不孕。

2、影响盆腔环境：受孕本身也是个非常复杂的过程，人体经过一系列精确的调节，使盆腔环境达到合适受孕的标准。而异位的子宫内膜会改变盆腔内的环境，不利于精卵结合，患者自然就无法怀孕。另外，异位生长的子宫内膜会伤害人体组织，造成盆腔器官粘连、输卵管扭曲变形等，导致排卵、受精卵着床和受精卵输送等任何一个环节出问题，患者都无法怀孕。

3、引起自身免疫反应：子宫内膜异位症患者体内B淋巴细胞会产生一种抗子宫内膜抗体，这种抗体会干扰早期受精卵的输送和着床，同时腹腔内因为子宫内膜异位病灶的存在而引起大量的巨噬细胞的聚集，这种巨噬细胞可以吞噬精子和干扰受精卵细胞的分裂，从而导致不孕。