异位的子宫内膜有受雌激素的影响，发生反复周期性出血从而导致病灶周围组织纤维化，最后形成结节或包块。

切开包块及结节，可见陈旧性出血及瘫痕，镜检可见子宫内膜腺体及间质在盆腔子宫内膜异位中，卵巢是子宫内膜异位最常见的位置。

女性朋友子宫内膜周期性增生、剥脱、出血的本性难改，因此，在移位处仍每月反复出血，越积越多，相互粘连，结为一硬块，形成子宫内膜瘤。异位在卵巢的内膜，周期性出血、积聚形成含巧克力样液的肿物---医学上叫卵巢巧克力囊肿。

较大的巧克力囊肿被认为来源于卵泡或黄体囊肿的间变。也可能是卵巢表面异位内膜向下生长的结果。