1、种植学说：经血逆流，由输卵管道流进入腹腔，种植在盆腔脏器的表层形成内异症病灶，这是主要原因。
2、化生内膜：体腔浆膜上皮组织受到刺激化生为子宫内膜，不在宫腔，就成了异位的内膜。
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3、良性转移：血液淋巴，良性转移。这是一种较为罕见的发病原因。可以异位到肺部、脑膜、心包、四肢等。
4、医源性的内膜移植：人为造成，多因剖宫产、分娩会阴侧切、人工流产等引起。
5、免疫防御功能缺陷：体内免疫功能缺陷，使得经血逆流至腹腔的子宫内膜发展成内异症病灶。
6、内分泌功能失调：孕激素缺乏，助长了内异症的发生发展。
7、遗传与体质的因素：有家族病史的人患此病居多。体质因素中如肥胖、超重、身长过高等亦有一定关系。
