与其他妇科疾病相比，子宫内膜异位症症状比较明显，早期发病征兆多为剧烈痛经，内分泌失调，性生活痛、盆腔痛等等，偶尔出现低热以及白带明显的增多和经期出现不适等。由于异位内膜存在雌、孕激素受体，因此临床症状和体征往往呈现其固有的周期性。

痛经、不孕、月经异常是子宫内膜异位症的典型症状。妇检可发现异位结节或包块，腹腔镜和B超有助诊断。在作妇科检查时，应对子宫后壁、子宫骶骨韧带和子宫直肠窝仔细检查，如模到1—2个豆粒大小之触痛结节即可作出诊断。但由于个别子宫内膜异位症可累及输卵管或并发输卵管炎症。故看到积水、不通等改变，甚至完全不显影时，并不完全排除本病。