一般妇女不育主要有两方面的原因。其中最多见的是输卵管闭锁，阻塞了精子和卵子会合的通道；其次是由于内分泌失调而没有排卵功能。但这两方面的原因都解释不了子宫内膜异位患者的不育。因为这类患者一般月经规律，有正常的排卵；且经过输卵管的检查，可见大多数卵管是通畅的。

然而，在手术或腹腔镜检查的时候，往往可以看到输卵管周围包括伞端部分的粘连，因此人们趋向于把内膜异位症的不育，解释为粘连所引起的输卵管功能失常，而这些细微的功能改变可能影响到卵子的收集和运行，从而妨碍了受孕。

对于年轻渴望生育的患者，当前治疗的目标，不仅在于消除散布在盆腔里的子宫内膜异位病变，同时还应尽可能恢复生育功能。应用激素类的药物和手术方法治疗内膜异位症均可改进患者的受孕能力。一般认为，经过假孕疗法，大约有30%病例治疗后受孕。